Comptabilité d'une micro entreprise en 2026 : ce qui est obligatoire, et ce qu'Indy fait gratuitement

La réponse courte

Ce guide rassemble ce que disent les sites officiels, Urssaf, impôts et service public, relus le 30 septembre 2026. Chaque chiffre porte sa source en bas de page.

Je le dis d'emblée, parce que c'est la règle de ce site : je suis rémunéré quand vous vous inscrivez sur Indy par mon lien. Ça ne change pas ce qui suit. Si la version gratuite vous suffit, et elle suffit à beaucoup de monde au début, je vous le dirai.

À qui s'adresse ce guide

À toute personne qui exerce sous le régime de la micro entreprise, qu'on appelle encore souvent auto entreprise : vente de marchandises, services commerciaux ou artisanaux, professions libérales. Les règles de tenue sont les mêmes pour tous, seuls les taux et les seuils changent selon l'activité.

Il ne concerne pas les sociétés, SASU, EURL ou SARL, dont la comptabilité obéit à d'autres règles, bien plus lourdes.

Ce que la loi vous demande vraiment

La micro entreprise a été pensée pour être simple, et sur la comptabilité elle l'est vraiment. Là où une société doit produire un bilan, un compte de résultat et une liasse fiscale chaque année, vous n'avez rien de tout ça.

Voici la liste complète, sans rien oublier et sans rien ajouter.

1. Tenir un livre des recettes

   Chaque somme encaissée, dans l'ordre des dates. C'est la seule obligation comptable qui concerne tout le monde. On y revient en détail juste après.

2. Tenir un registre des achats, si vous vendez des marchandises

   Il concerne les commerçants et l'hébergement : le détail de vos achats, année par année. Les fiches officielles ne le demandent pas aux professions libérales.

3. Déclarer votre chiffre d'affaires à l'Urssaf

   Chaque mois ou chaque trimestre, en ligne, même quand vous n'avez rien encaissé. C'est cette déclaration qui calcule vos cotisations.

4. Faire des factures conformes

   Avec les mentions obligatoires, dont celle qui dit que vous ne facturez pas de TVA. Et à partir du 1er septembre 2027, des factures électroniques.

5. Surveiller vos seuils

   Celui de la TVA, et celui du régime micro lui même. Les dépasser sans le voir coûte cher.

6. Ouvrir un compte bancaire séparé, le jour où il le faut

   Il devient obligatoire quand votre chiffre d'affaires dépasse 10 000 euros deux années de suite. En dessous, votre compte personnel suffit.

Le livre des recettes, ligne par ligne

C'est le cœur de votre comptabilité, et il est beaucoup plus simple que son nom. Un tableau suffit, sur papier, dans un tableur ou dans une application.

Chaque ligne correspond à un encaissement, et porte trois informations obligatoires selon le service public : le montant et l'origine de la recette, c'est à dire le client ; le mode de règlement ; et la référence de la pièce justificative, le plus souvent le numéro de la facture.

Quelques règles de tenue, toutes tirées de la même fiche officielle :

Les recettes s'additionnent tous les trois mois. Si vous vendez au détail ou rendez des services à des particuliers, vous pouvez écrire une seule ligne par jour pour les ventes de moins de 76 euros, au lieu d'une ligne par client.

Le livre peut être tenu sur ordinateur. Une fois une écriture enregistrée, elle ne se modifie plus : une erreur se corrige par une nouvelle ligne, pas en effaçant l'ancienne.

Le livre et les pièces qui le justifient se conservent dix ans à partir de la clôture de l'exercice concerné.

Déclarer son chiffre d'affaires à l'Urssaf

Par défaut, la déclaration est mensuelle. Vous pouvez demander à passer au trimestre, et revenir au mois en le demandant avant le 31 octobre de l'année précédente.

Elle se fait obligatoirement en ligne, sur le site de l'Urssaf dédié aux auto entrepreneurs, avant la fin du mois qui suit la période déclarée. Pour le trimestre, les dates limites sont le 30 avril, le 31 juillet, le 31 octobre et le 31 janvier.

Vous déclarez ce que vous avez réellement encaissé, pas ce que vous avez facturé. Une facture envoyée en septembre et payée en octobre se déclare en octobre.

Le taux des professions libérales non réglementées a beaucoup bougé ces deux dernières années : 21,1 % début 2024, puis 23,1 %, puis 24,6 % en 2025, et 25,6 % depuis le 1er janvier 2026. Si vous avez lu un chiffre plus bas ailleurs, il est probablement ancien.

La bonne nouvelle, dite par l'Urssaf elle même : zéro euro encaissé, zéro euro à payer. Les cotisations sont un pourcentage de ce que vous gagnez, il n'y a pas de minimum.

Un mot sur l'impôt, qui se greffe sur cette même déclaration. Si le revenu de votre foyer n'est pas trop élevé, vous pouvez choisir le versement libératoire : vous payez votre impôt en même temps que vos cotisations, à un taux fixe de 1 % pour la vente, 1,7 % pour les services commerciaux et artisanaux, et 2,2 % pour les professions libérales.

Pour une personne seule, il faut un revenu fiscal de référence inférieur à 29 579 euros, selon la fiche du service public. L'option se demande avant le 30 septembre pour valoir l'année suivante, ou dans les trois premiers mois après votre création. Elle n'est pas toujours avantageuse : si vous payez peu ou pas d'impôt aujourd'hui, elle peut vous faire payer davantage.

Les deux seuils à ne pas rater

Le premier seuil décide si vous facturez la TVA. Le second décide si vous restez en micro entreprise. Ce ne sont pas les mêmes, et le premier arrive beaucoup plus tôt.

Tant que vous restez sous le premier seuil, vous ne facturez pas de TVA, et chaque facture doit le dire avec la mention « TVA non applicable, article 293 B du code général des impôts ».

Entre les deux seuils, la tolérance vaut une année : vous devenez redevable de la TVA au 1er janvier suivant. Au delà du seuil de tolérance, c'est immédiat : la TVA est due sur vos opérations dès le premier jour du dépassement, et vous devez la facturer à vos clients à partir de ce jour là.

Ce second seuil est plus souple : dépasser une seule année ne vous fait pas sortir du régime. Il faut deux années de suite au dessus pour basculer vers un régime réel. Mais à ce niveau, vous facturez déjà la TVA depuis longtemps.

Vos factures, et ce qui change en 2027

Une facture de micro entrepreneur doit porter une série de mentions, et en oublier une n'est pas une simple coquille. Voici celles qui vous concernent à coup sûr, d'après la liste officielle :

• La date d'émission, et un numéro unique qui suit une séquence continue, sans trou.
• La date de la vente ou de la prestation.
• Votre nom et prénom précédés ou suivis de la mention « Entrepreneur individuel » ou « EI », votre adresse et votre numéro Siren.
• Le nom de votre client, et son adresse si c'est un particulier.
• Le détail de ce que vous facturez : quantité, prix unitaire hors taxes.
• Le total, et la mention de l'article 293 B tant que vous êtes en franchise de TVA.
• La date de paiement, et le taux des pénalités de retard.
• Pour un client professionnel, l'indemnité forfaitaire de 40 euros pour frais de recouvrement.

Puis vient la réforme dont tout le monde parle, la facturation électronique. Elle concerne aussi les micro entrepreneurs, y compris en franchise de TVA : le site des impôts le dit explicitement. Un PDF envoyé par courriel ne sera plus une facture valable entre entreprises.

Ce qu'Indy fait, formule par formule

Indy est un logiciel de comptabilité pour indépendants. Il est immatriculé par l'administration fiscale comme plateforme agréée pour la facturation électronique, ce qui règle d'un coup la question du 1er septembre 2026, même avec la formule gratuite.

Voici ce que contient chaque formule pour une micro entreprise, lu sur sa page de tarifs le 30 septembre 2026.

La lecture honnête de ce tableau : la formule gratuite fait tout ce qui est pénible à faire à la main, c'est à dire des factures conformes, numérotées sans trou, et le classement de vos opérations bancaires. Elle ne fait pas à votre place les deux gestes réguliers, le livre des recettes et la déclaration.

Or ces deux gestes sont les plus simples de la liste. Si vous encaissez une dizaine de paiements par mois, un tableau et cinq minutes sur le site de l'Urssaf suffisent. La formule Premium devient intéressante quand le volume grandit, ou quand vous savez que vous oublierez.

Faut il payer, selon votre situation

Les questions qu'on se pose

Ce que je retiens

La comptabilité d'une micro entreprise fait peur surtout par son nom. En réalité, elle tient en un tableau tenu au fil de l'eau et une déclaration par mois ou par trimestre. Le reste, ce sont des règles à connaître une fois : les mentions d'une facture, deux seuils, un compte séparé le jour venu.

Ce qui change en ce moment, c'est la facture électronique, et c'est la vraie raison de choisir un outil en 2026. Pas pour la comptabilité elle même, mais parce qu'une plateforme agréée devient nécessaire. La formule gratuite d'Indy y répond sans rien vous coûter.

Payer ne devient utile que le jour où le temps que vous passez sur vos déclarations vaut plus que quinze euros par mois. Pour beaucoup de monde, ce jour là n'arrive qu'après la première année.

Les sources